市场上一般把2001年至2005年这五年大熊市中入市的投资者称为第三代股民。在此期间，基金、保险资金、QFII等机构投资者纷纷入市，逐渐改变了散户占主导的局面。
1998年3月27日，经中国证监会批准，南方基金管理公司和国泰基金管理公司分别发起设立了规模均为20亿元的两只封闭式基金——基金开元和基金金泰，拉开了中国证券投资基金试点的序幕。在封闭式基金成功试点的基础上，2000年10月8日，中国证监会发布了《开放式证券投资基金试点办法》。2001年9月，我国第一只开放式基金——华安创新诞生。
截至2010年9月底，偏股型基金的总资产达2.92万亿元，持有的股票市值达2.32万亿元，与同期的A股流通总市值相比，占比达28%，为历史上的最高水平，基金已成为A股市场的主要投资者。
2000年8月，为了给社会保险基金提供战略储备，弥补今后人口老龄化高峰时期的社会保障需要，国务院决定建立“全国社会保障基金”，同时设立“全国社会保障基金理事会”，负责管理运营全国社会保障基金。
成立十年来，社保基金借助股市快速发展壮大。截至2009年底，社保基金自成立以来的累计投资收益额2448.59亿元，年均投资收益率为9.75%。
证监会不仅积极扩大国内机构投资者入市，也引入了合格境外机构投资者（QFII）。2003年7月9日上午10时17分，在北京东方君悦大酒店浮碧厅，来自国内外的40多家媒体与瑞银高管共同见证了历史性的一刻：QFII第一单的指令此刻正在发出，10点19分左右，也即指令发出的2分钟后，首单买入的四只股票全部确认成交，备受瞩目的QFII正式登上中国证券市场大舞台。
截至2010年10月，103家外资机构获得QFII资格，其中94家获得QFII额度，总计为190亿美元。QFII给A股市场带来的不止是资金，还有投资文化。其价值投资的理念给了中国股民很多触动。
